斑痣的治疗方法很多，要看它的大小、部位和性质等而定。总体来说，治疗可分为非手术疗法和手术疗法两大类。
一、非手术治疗
适用于发生于面颈部的颗粒状小痣，如皮内痣、雀斑以及较淡而浅在的色素斑等。
采用的技术有多种，包括激光、化学制剂烧灼法（三氯醋酸、石碳酸）、冷冻疗法（二氧化碳雪、液氮等）、电凝或电解疗法等。而目前使用较多的方法是激光，
（一）非手术治疗的缺点
1、治疗后斑痣消失，因而得不到它的明确病理诊断。也有可能因没有彻底清除而导致严重后果。
2、斑痣较大，色素细胞位置较深时，通常需多次治疗才能奏效，有时会因过度治疗，从而造成以下后果，如局部出现明显疤痕、疤痕增生、色素失落而形成白斑。
二、手术疗法
是指把颗粒状或小片斑痣进行整块切除，然后把创缘拉拢缝合。
而对于面积较大的斑痣，不能一次切除或分期切除缝合者，则须采用游离植皮术或皮瓣转移术来修复创面。植皮后早期皮色可能看起来较暗，和周围皮色有差异，但过几年后就会“了无痕迹”。
（一）、手术治疗的优点
可以明确斑痣的病理性质，一旦有恶性变化，可以尽早采取措施，及时治疗。
手术切除原则以一次全部切除为佳，既要有广度，又要有适当深度，以避免部分部位较深的斑痣细胞未被切掉，从而造成术后植皮片上又重新出现色素斑点。
三、几种特殊斑痣的治疗
（一）、多部位多发性斑痣
在治疗上是一个困难的问题。多采用选择性切除原则，即切除面颈部显眼部位的黑痣，而在隐蔽部位的斑痣则任其自然，不予处理。对极少数波及整个躯干或肢体的巨痣，目前尚无好的治疗方法，对于是否有恶变可能，目前也尚无肯定的结论。
（二）、交界痣
生长在足底、手掌部的斑痣多属于交界痣，有恶变的潜在危险，因此不论在临床上是否确诊，都宜作早期预防性切除。
如因摩擦刺激而出现破溃者，应尽早进行扩大根治手术，严重者甚至需要进行截肢。此外，男性唇边出现的黑痣，因受剃须的经常性刺激，也有恶变的倾向，宜早作预防性切除。
四、警惕恶性黑色素瘤
黑色素瘤是指有恶性变化的色素斑痣，但并非所有的黑色素瘤一定由斑痣恶变而。
黑色素瘤的发病率很低，仅占全身恶性肿瘤的1-2％。多在受到创伤、慢性刺激等过度刺激下而发生的恶变。
足跟、手掌、头颈等部位存在的斑痣容易发生恶性黑色素瘤，因此当出现下述情况时应高度警惕，如斑痣逐渐增大、周围血管扩张、有炎症反应、色素增深并向周围正常皮肤侵延、出现卫星状小黑点、斑痣破溃出血、经常发生感染、发痒疼痛。
