早晨起来空腹喝一杯咖啡，可以促进肠道蠕动，对缓解便秘很有效。咖啡因能够阻断肠道弛缓信号，刺激肠道肌肉加强收缩。也就是说，咖啡因可以不管肠道是否已经做好了排泄准备，直接就能促进肠道加强蠕动，从而产生便意。
不过，因为人体很容易对咖啡因产生依赖，所以经常空腹喝咖啡，会导致胃酸过多、烧心等症状。
另外，长期服用便秘药者，如果喜欢喝咖啡，反而会加重便秘，有的人可能还会得腹泻型的过敏性肠道症候群。咖啡中的有益成分能够帮助排除肝脏内的毒素等，所以提倡适量地饮用咖啡，但饮用的同时应注意补充水分。因为咖啡中的可可碱有利尿作用，人体一旦缺水，就容易加重便秘。