头一阵一阵跳着疼的原因常见为原发性头疼或继发性头疼等，具体如下：1、原发性头疼：一般多半见于血管搏动性头疼即偏头疼，其特点为病史较长，患者有头疼病史较多年。间断出现，头疼发作一次持续4-72小时。部分人睡觉后次日即可恢复，此类疼痛可能为原发性偏头疼；2、继发性头疼：出现继发性头疼的原因可为继发于颅内外的器质性疾病，也可为继发于全身的系统性疾病，颅内疾病如脑出血、蛛网膜下腔出血、脑部炎症如脑炎、脑膜炎、硬膜下血肿、头部外伤引起硬膜下血肿、静脉窦血栓形成引起颅内高压、肿瘤及寄生虫病等都可出现此类头疼；3、其他：头面部任何器质性疾病也可引起此类疼痛，如神经疼、颞动脉炎及全身系统性疾病，焦虑、抑郁时也可出现此类现象。