自然流产后判断是否流干净，主要是从患者症状和客观检查进行分析：1、患者症状：如果流产比较干净，大多数出血应该在流产后的1-2周左右能够结束。如果出血时间＞2周，可能是流产不干净、宫内有残留所致；2、客观检查：B超是最重要的一项检查结果，血清HCG、B超是自然流产后常规需要检查的项目，大多数在自然流产以后的第二天或者当时会进行检查，判断是否发生自然流产。怀孕后出血比较多，不代表发生流产，试管婴儿的孕妇也容易出现大出血的情况。因此通常在流产的同时或者第二天进行B超检查，判断是否自然流产。多数情况下流产不会特别干净，需要给予一定的药物治疗。如果宫内残留较大，则可能需要进行清宫手术。如果没有明显残留，通常1-2周后仍需继续复查。正常情况下，血清HCG应该在1个月左右降为阴性。