右侧卵巢囊肿的原因，有可能多种多样，分为生理性因素和病理性因素，主要分析如下：一、生理性因素：1、卵巢黄体囊肿：有可能是生理状态下的，如女性在妊娠早期，比较容易出现卵巢黄体囊肿。这个卵巢黄体囊肿，其实不用过于担心，绝大多数情况下，患者没有任何的临床症状，随着时间的延长，卵巢黄体囊肿绝大多数都能够自行消失；2、卵泡形成的小囊肿：还有一部分可能就是卵泡在生长发育的过程中，形成较小的囊肿，随着时间的延长，这些囊肿也有可能会自行消失，针对于这一系列的生理状态下的囊肿，并不用过于担心；3、巧克力囊肿：还有卵巢组织内膜异位囊肿，常常又称为巧克力囊肿，这是子宫内膜异位到卵巢上。随着每次月经的时候，子宫内膜的剥脱出血，异位到卵巢内部，子宫内膜也能剥脱出血，久而久之，其出血就会积存在卵巢内部形成囊肿，这些血液随着时间的延长，将会有水分被吸收，变得越来越黏稠，颜色会越来越深，所以就会变成巧克力样的液体，这个时候常常又会将卵巢的子宫内膜异位囊肿，称为巧克力囊肿。二、病理性因素：1、囊腺瘤：还有一些可能涉及肿瘤的原因，比如有可能是卵巢上皮来源的卵巢的浆液性的囊腺瘤、黏液性的囊腺瘤等，在超声检查下都能够发现，呈现囊肿样改变；2、畸胎瘤或卵巢囊肿：有的时候也有可能是畸胎瘤，或是因为输卵管系膜的囊肿，在超声上无法进行区分，也会被划分为卵巢囊肿。但实际上通过进行手术探查，才能够明确发现，这些囊肿具体的发病的原因，所在的位置，其性质是良性还是恶性的，明确诊断，才能够明确下一步的治疗方案。