脑干血栓后遗症要看位置，具体如下：1、中脑：病情较重，会影响意识状态，中脑梗死会导致意识状态丧失，出现昏迷、叫不醒。在脑干的中脑部分，部分梗死的梗死灶比较小，通过康复训练症状可以逐渐修复；2、桥脑：出现横断面积比较大的梗死，同样也比较重，会导致四肢瘫痪、不能讲话，即闭塞综合征；3、延髓：脑干的下部称为延髓，如果延髓梗死，会出现喝水呛、感觉异常、说话不清，即Wallenberg综合征，此时通过功能康复可以使症状减轻，但部分患者脑干位置往下是循环系统和呼吸系统的中枢系统，此时出现梗死，会出现呼吸骤停、心脏骤停。