上厕所小便有点疼，原因分析如下：1、尿道炎：最常见于尿道炎，病人发生淋菌性尿道炎时，由于感染性致病菌刺激尿道黏膜，会导致黏膜红肿、糜烂，会出现黏膜局部疼痛症状。部分病人还会出现局部水疱、脓疱，水疱、脓疱破裂后会形成脓性分泌物，病人还会出现尿道发痒的症状。小便、上厕所尿道有点疼，还见于非淋菌性尿道炎。病人发生非淋菌性尿道炎时也会出现尿道隐痛的症状，部分病人还会出现尿道口稀薄分泌物；2、尿道结石：上厕所小便有点疼，还见于尿道结石病人。病人发生尿道结石时，会引起尿道疼痛症状；3、输尿管末端结石：上厕所小便有点疼，还见于输尿管末端结石。输尿管末端结石病人，由于结石刺激输尿管黏膜，会引起会阴部小便放散性疼痛，病人在上厕所时，会出现尿道疼痛症状。病人出现上述症状时，需及时到泌尿外科就医，通过规范的检查和治疗，多数病人小便有点疼症状会明显好转。