多数男性尿道刺痛患者能够自愈，男性尿道刺痛多是由于泌尿系感染引起，此类感染通常是常见的非特异性感染。如生活中常见细菌，包括粪球菌、链球菌、大肠杆菌等均会造成泌尿系感染，泌尿系感染会导致一系列症状，包括尿道刺痛，同时会合并有尿频、尿急，甚至偶尔有血尿等症状。当患者出现由感染引起的上述症状时，通过抗菌药物的治疗可以改善，但即使不治疗，可以多喝水，注意休息，自身免疫力和抵抗力可以发挥作用，使疾病逐渐好转。只有极少数特殊性感染，如泌尿系结核等，不治疗疾病会越来越严重。