女性小便时候疼痛可能有以下几种原因：1、尿路感染：尤其是育龄期女性，尿路感染发生率较高，与较多原因有关。可能由于劳累、疲劳、熬夜，状态不佳。这时因为自身原因造成的免疫力下降，此时细菌可能占有优势，发生尿路感染的情况；2、外界因素：如卫生或者夫妻生活造成尿路感染，也会造成尿道疼痛。小便的时候疼，不管何种原因造成，均需要及时就医进行尿常规检查，判断是否存在其他问题；3、结石、肿瘤：刺激尿路，造成小便时发生疼痛。这种情况虽然比较少见，但是确实存在，需要进一步检查。小便时发生疼痛，不能掉以轻心，以为就是尿路感染的情况，其实也可能是有其他的问题存在，不论哪种原因所造成，需要进一步检查。