甲硝唑和奥硝唑属于同类抗生素，都是属于硝基咪唑类的抗菌药物，主要是通过分子中所含有的硝基干扰厌氧菌的代谢过程，起到抗菌的作用，因此甲硝唑和奥硝唑的抗菌机制基本相同。在疗效方面，奥硝唑的抗菌作用可能强于甲硝唑，有些病原菌可能对甲硝唑耐药，而对奥硝唑敏感。在药物安全性方面，奥硝唑的副作用可能要少于甲硝唑，比如在胃肠道反应方面，奥硝唑所引起的胃肠道不适发生率或者程度要低于甲硝唑。另外，相对于甲硝唑而言，奥硝唑不容易发生双硫仑反应。总之，甲硝唑和奥硝唑是属于硝基咪唑类的抗菌药物，这两种药品在疗效和安全性方面都有一定的差异，患者要遵照医嘱合理选择药品，特别是对于抗菌药物的品种选择要遵照医嘱。