甲沟炎化脓后，主要是针对细菌感染进行用药，常用的药物如下：1、消毒药物：常见的伤口消毒剂是碘剂，包括活力碘或碘伏，可以起到局部杀菌和消肿的作用，酒精也可以使用，70%-75%的医用酒精可以起到较好的杀菌作用，同时可以使局部消肿，还可以持续性湿敷，达到持续性起作用的效果；2、外用抗生素：如可以使用红霉素药膏或夫西地酸钠的药膏进行涂抹，另外甲沟炎化脓也可以使用鱼石脂软膏局部涂抹，鱼石脂软膏有消肿的作用，但是不能长期使用，因为鱼石脂软膏的油性会起到屏障伤口作用；3、口服抗生素：包括头孢或沙星类制剂，需要注意沙星类制剂的适应症和年龄的限制。针对甲沟炎的化脓，除使用以上药物外，还要配合其他护理和治疗措施，才能起到比较好的治疗效果。