高密度脂蛋白胆固醇偏低的原因，与患者自身遗传以及生活方式有一定关系，高密度脂蛋白胆固醇的减低相当于低密度脂蛋白胆固醇升高，对健康有害。高密度脂蛋白胆固醇偏低最常见的原因是自身代谢的问题，增加运动量或者药物能升高高密度脂蛋白胆固醇，但是烟酸类药物的副作用较大，往往出现恶心、呕吐，患者不能耐受，所以用药物的方式升高高密度脂蛋白胆固醇的方法效果较差。 增加运动、改善生活方式的效果较好，是较倡导的措施。对于高密度脂蛋白胆固醇偏低，目前医学的研究，包括治疗手段相对比较薄弱。高密度脂蛋白胆固醇低的危害小于低密度脂蛋白胆固醇高，所以不要过于担心，应以改善生活方式为主。