做完咽拭子后喉咙疼痛为异常现象，通常不会引起疼痛。当咽喉出现疼痛时，通常由于炎症引起，比如急性咽喉炎，患者会出现咽喉疼痛，尤其是吞咽时疼痛明显。部分患者可能会伴有发烧、咳嗽等症状。当患者出现上述症状后，通常需给予抗炎治疗，比如抗生素包括头孢类或者阿奇霉素类药物进行口服，局部可给予治疗咽喉炎的中成药、含片以及漱口水进行治疗。通常经过1周左右治疗，炎症可得到控制，咽喉疼痛可得到缓解。此外，患者做完咽拭子后，咽喉如果出现疼痛，可能是做咽拭子时操作比较粗暴，引起咽喉外伤，而出现疼痛。此时可检查咽喉，如果有黏膜损伤，可以用漱口水或含片进行治疗。观察几天后，患者症状通常会缓解、痊愈。