39℃高烧不退的处理措施如下：1、注意护理、物理降温：如用温水擦浴；2、应用药物：如对乙酰氨基酚、布洛芬，在应用退烧药时要注意观察出汗是否增多，是否需要额外补充水分、淡盐水、电解质，因为退烧药可能导致脱水，甚至导致电解质过低；3、及时就诊：观察高烧不退是否伴随其它特别严重的表现，比如身体情况特别差、萎靡不振、特别乏力，出现此情况要及时到医院就诊。实际高烧不退的原因很多，医生可以帮助病人把确切的原因找到，比如是否存在特殊感染、肿瘤性疾病、免疫性疾病。找到病因以后医生会帮助进行相应的治疗，细菌感染要及时应用抗生素，免疫问题要用免疫调节药，肿瘤问题应该进行肿瘤治疗。