宝宝脑发育不良的原因不同，针对性的治疗方法也会不同，具体如下：1、染色体发育异常：这种情况引起的脑发育不良，目前尚无特效的治疗方法，通常需要后期进行功能性训练，从而改善功能状态；2、出生缺血、缺氧：这种情况也可能造成脑发育损伤，早期可以适当应用保护脑神经的药物，同时给予高压氧舱或其它吸氧治疗；3、疾病因素：例如苯丙酮尿症或甲状腺功能低下等，发现以后需要及时进行干预，例如患有苯丙酮尿症的宝宝，可以适当给予低苯丙氨酸饮食或药物治疗，脑发育不良会得到部分改善。如果出现甲状腺功能低下，可以早期服用甲状腺素片，对于脑功能会有明显的改善作用。