小肚子痛是指小腹痛，吃了避孕药小腹痛，可能是以下原因：1、摄入了外源性的激素：无论是紧急避孕药还是短效避孕药，都会含有激素成分，如紧急避孕药含有孕激素，而短效避孕药含有雌激素和孕激素。因此，服用避孕药之后机体接收了外源性的激素，可能对卵巢局部造成一定刺激，可能引起小腹痛。但绝大部分女性经过休息之后，小腹痛的症状通常会消失；2、子宫内膜变化刺激机体：短效避孕药会导致子宫内膜变薄，而紧急避孕药会使子宫内膜异常增厚。而子宫内膜在短时间内变薄、增厚，可能刺激机体引起子宫平滑肌收缩，所以也可能导致小腹痛。此时建议女性适当卧床休息；3、其他疾病：吃了避孕药之后出现小腹痛，也建议排除其他疾病的可能性，比如盆腔炎症、肠炎、消化不良、泌尿系统疾病等情况也会引起小腹痛。