阿奇霉素的耐受性非常好，不良反应的发生率比较低，多为轻到中度的可逆性反应，一般都可以恢复，常见胃肠道反应包括腹泻、恶心、腹痛、稀便、呕吐等。阿奇霉素可引发皮肤反应，容易引起皮疹和瘙痒，还容易引起厌食、阴道炎、头晕或者呼吸困难等不良反应。临床中还观察到＜1%的不良反应，比如消化不良、胃肠道胀气、黏膜炎、口腔念珠菌病以及胃炎等，在神经系统方面容易引起头痛和嗜睡，在过敏反应中容易引起支气管痉挛。此外，还有比较少的味觉异常现象。 以下情况可能是阿奇霉素的不良反应，但是与阿奇霉素的相关性还不是很清楚： 1、过敏反应会引起关节痛、血管神经性水肿、荨麻疹、光过敏； 2、心血管系统的心律不齐、室性心动过速； 3、胃肠道极少见的伪膜性肠炎； 4、泌尿生殖系统的急性肾衰； 5、造血系统容易引起血小板减少； 6、肝胆系统曾经有报道，阿奇霉素引起肝炎和胆汁淤积性黄疸，偶尔也会引起肝坏死和肝衰竭； 7、神经系统的攻击性反应、神经质、焦躁不安等； 8、皮肤附属组织有非常罕见的红斑以及Stevens-Johnson综合征，还有毒性表皮溶血性坏死等都有报道； 9、有报道大环内酯类抗生素容易损害患者听力，引起耳鸣或者耳聋；据调查研究表明这种现象与患者持续大剂量使用有关，通过随诊发现大多患者的听力都可以恢复。