卵巢囊肿怀孕后是否能消失要根据卵巢囊肿的具体情况，卵巢囊肿分为生理性和病理性。具体如下：1、生理性卵巢囊肿：包括卵泡囊肿、黄体囊肿、滤泡囊肿等。怀孕后有可能发生的黄素化囊肿，此种卵巢囊肿突然发生在HCG比较高，葡萄胎的时候。如果是生理性卵巢囊肿，在怀孕后有可能会消失，但是在黄体酮、HCG的作用下，也有可能会新长出卵巢囊肿；2、病理性卵巢囊肿：比如巧克力囊肿，在怀孕后孕激素的作用下，有可能会较前缩小甚至消失。但是如果是其他的卵巢囊肿，比如卵巢浆液性囊肿、黏液性囊肿或者其他交界性甚至恶性卵巢肿瘤，在怀孕后可能会进一步进展或者稳定 但是不会消失。所以如果在怀孕前发现有病理性卵巢囊肿，建议尽量在怀孕前进行手术。特殊的情况就是巧克力囊肿，卵巢囊肿有可能影响怀孕，但是如果直径<4cm，能怀孕对卵巢囊肿本身有一定的促进萎缩的作用。