怀孕初期先兆流产的原因常见为偶发性激素水平波动及情绪因素等，具体如下：1、偶发性激素水平波动：大部分情况可能为偶发性的激素水平波动，如黄体功能不足、孕激素水平分泌不足。此阶段有可能会有轻微腹痛，会有轻微的、少许的、点滴的阴道出血。但大部分情况下，补充黄体酮治疗或充分增加休息后，大部分妊娠可持续。有资料表明若既往无反复多次的流产史，可不用给予任何黄体酮支持治疗。此类先兆流产，更多可能与体内激素水平分泌出现一过性波动有关；2、情绪因素：孕妇本身出现紧张、焦虑的情绪、休息不好、睡眠不好或过于劳累等，可能也为导致先兆流产的原因；3、基因染色体问题：可能为胚胎本身生长发育过程中，基因染色体的问题导致出现先兆流产，此情况下应给予充分的保胎处理，但在未来较可能不可避免发生流产；4、孕妇本身患有疾病：孕妇本身患有疾病，如高血压、糖尿病、血糖控制不好、心脏功能衰退、肾功能低下、抗磷脂综合征或风湿免疫科疾病等。此情况下，也易导致发生先兆流产。