长在宫颈上的囊肿，大部分是宫颈慢性纳式囊肿，不需要治疗。大到一定程度合并感染时，少数必要时采取手术切除。子宫上的囊性腺腺肌病，部分病人可引起痛经，必要时才采取手术。一般的囊肿需定期观察，大部分的囊肿长在卵巢上。如果出现卵巢囊肿，较小的需定期随诊，如果>4cm，需观察囊肿是否持续存在。原则上间隔半年以上叫做持续存在，有必要手术治疗。卵巢上的囊肿处理更积极，子宫上的囊肿处理反倒没有那么积极。因为子宫上的囊肿大部分均属于良性，而卵巢上的囊肿有良性、交界性，甚至恶性，且卵巢部位相对比较隐匿。