如果女性在怀孕初期有阴道咖啡色分泌物，首先要明确是异常阴道出血。阴道出血量少，在宫腔以及阴道内残存一定的时间，铁元素析出。阴道分泌物颜色逐渐变深，可能会变成咖啡色、深褐色，甚至变成黑色，出现此类症状的原因如下：1、异位妊娠：异位妊娠时女性会出现相应停经、阴道出血和腹痛症状，但是并不一定每个女性，都会出现非常明显的上述症状；2、怀孕后激素水平分泌不足：由于黄体功能不足等原因，会增加先兆流产风险。在这种状态下，容易出现少许的阴道出血；3、宫颈息肉：出血在阴道内残存时间过久，同样也会变成咖啡色分泌物。