肺结核治疗失败的原因包括结核菌本身、病灶较重以及用药不规范等，具体如下：1、结核菌本身：结核菌可能是好治的类型，也可能是难治的类型，如果属于难治的类型，对现有的抗结核药物产生耐药性，就意味着用药再多、再好也无法控制结核菌。为了查明治疗失败的原因，可以通过肺结核菌培养和药物敏感性试验来确定；2、病灶较重：肺结核病灶特殊也可能导致治疗失败，例如病灶较大，抗结核药物无法进入病灶内发挥有效的抗结核菌作用；3、用药不规范：选择不合适的治疗方案也是导致治疗失败的原因之一，应根据病人的情况来及时调整治疗方案。