扁桃体切除通常没有后遗症，扁桃体是免疫器官，在儿童时期呈生理性肥大，在10-14岁扁桃体会逐渐萎缩，免疫功能会逐渐下降。扁桃体切除要考虑以下几种情况：1、慢性炎症状态：引起病人反复的急性扁桃体发作，出现高烧、咽痛，吞咽疼痛加剧，检查时扁桃体表面充血，脓性的分泌物增多，每年引起2-3次，连续2-3年，考虑将扁桃体切除；2、出现长期低热：与扁桃体的慢性炎症有关，病人长期低热，这种情况也要考虑扁桃体的切除；3、引起呼吸困难：扁桃体由于慢性炎症变得肿大，肿大明显，引起咽腔狭窄，导致病人打鼾，打鼾过程中暂停呼吸，引起睡眠呼吸暂停综合征，病人出现一系列缺氧的情况，需要将扁桃体切除。