导致胎儿畸形的原因较多，常见原因如下：一、内在因素：1、胎儿自身发育异常：如染色体异常，目前可以通过相关检测进行筛查，如羊水穿刺、绒毛穿刺或脐血穿刺，作为相关染色体或基因方面的检查，还可以通过超声，对胎儿进行结构上的判断，如唇裂、先心病或肾脏畸形等一系列问题，都可通过超声检查发现；2、遗传因素：有可能会导致胎儿畸形；3、母体因素：孕妇的年龄、精子和卵子的质量。二、外界因素：1、理化因素：有害的物理环境、化学环境，可能会导致胎儿染色体或基因突变，从而造成胎儿畸形；2、药物因素：部分药物有可能导致胎儿的畸形。胎儿畸形是多因素、多通路，多基质导致的病变，胎儿畸形的原因，通常是多种原因共同导致的结构或基因的变化。