半边后脑勺疼痛，有以下原因：1、枕大神经痛：比较常见，脑内常没有器质性病变；2、脑内器质性病变：诊断头痛的患者，首先做的是排除脑内器质性病变，结合发热、头痛、恶心、呕吐症状排除。其次排除肿瘤病史等，结合前期的病史、疾病病程进行脑电图、血常规、C反应蛋白以及头颅的核磁共振检查、CT检查。有的患者是普通的脑出血，可能会出现后脑勺疼痛，表现出来的是神经痛。所以半边后脑勺疼痛患者要先排除脑内病变，排除以后诊断神经痛，可以按照神经痛治疗，服用加巴喷丁或普瑞巴林，加入辅助营养神经的药物进行治疗。