孕酮低造成胚胎停育的原因，可能因为孕酮对子宫内膜、子宫肌肉作用消失。前提胚胎本身没有问题，胎停孕只是因为孕酮低造成，孕酮对子宫内膜作用，主要在雌激素作用上，使子宫内膜变成分泌期变化。主要表现腺体变长，然后弯曲，血管也增长弯曲，间质比较疏松、水肿，此外间质当中存在较多营养物质，子宫内膜较厚，此种情况有利于孕卵着床，和胚胎生长发育需要。对子宫主要抑制子宫收缩，防止子宫排除宫内物作用。如果孕酮低，对子宫内膜作用消失，破坏孕卵、胚胎生长环境，以及对子宫肌肉抑制作用消除后，造成子宫收缩，增加流产。