睡醒后一只眼睛特别疼，先要闭眼睛，休息片刻。用清水洗脸、眼睛，观察眼睛疼痛是否消失。若因为疲劳，睡觉时眼睛受到压迫，通过休息、洗脸、洗眼睛，疼痛通常会减轻或消失。若疼痛仍然较明显，可以再加用人工泪液滴眼液点眼睛。若眼睛疼痛消失，可能是因为结膜囊或角膜、结膜出现问题。通过人工泪液分布，眼睛得到润滑，疼痛得到缓解。若疼痛仍然存在，甚至伴随结膜充血、发红，可以加用抗生素滴眼液，如左氧氟沙星滴眼液、妥布霉素滴眼液。点眼睛后休息0.5个小时，再进行判断。若疼痛仍然存在，同时存在视力下降、视物模糊，可能是因为角膜或眼内存在问题。需要到医院进一步检查，观察有无角膜炎、角膜损害、眼压是否高，前房有无炎症、充血，排除角膜炎、青光眼以及虹膜睫状体炎等。所以睡醒后一只眼睛特别疼痛，一般通过自救方法处理。若没有明显好转，需要到医院专业眼科，进行相关专业方面检查。