咖啡因对胃有一定损伤，胃部黏膜有自身保护机制，可分泌胃液中和胃酸，或抵抗对胃的刺激。对于多数健康、没有胃病的人群，饮用咖啡没有问题。如果有胃部疾病，如糜烂性胃炎、溃疡等，此时摄入咖啡因，可能刺激胃酸进一步分泌，从而加重对胃黏膜的损伤，进一步加重反酸、烧心或上腹疼的症状。咖啡因可以兴奋神经，即具有提神作用，但部分人进食后，可出现心跳加快甚至手抖。如果出现此类症状，应减少摄入咖啡或停止食用。