小便刺痛的原因有很多，如尿道感染、泌尿系感染以及膀胱镜检查、插尿管、尿道操作等，尿道有分泌物时可进行病原菌检查，如尿培养、分泌物培养、涂片检查，病原菌有细菌、支原体、衣原体、淋球菌等，根据病原菌使用药物治疗，如有插尿管史、尿道操作史要做尿常规检查，尿液中有白细胞是泌尿系感染，可做细菌病原菌培养、大量饮水、应用抗生素以及治疗前列腺的药物，大量饮水有助于缓解小便刺痛。