胃间质瘤术后需根据手术情况以及术后危险度分级决定是否需要药物治疗，如手术达到根治，即术后临床未探查到肿瘤残留，需根据术后病理危险度分级决定是否需要药物治疗。按照常用的NIH2008分级标准，对于低危、极低危患者，术后通常不需进一步药物治疗；中高危患者需要进行术后辅助靶向药物治疗，部分患者至少服用药物三年；高危患者需要延长辅助治疗时间至五年甚至更长。对于未进行根治性手术，仅进行减瘤手术者，术后体内存在肿瘤残留需要进行药物治疗。