部分化疗反应可以预防，部分可以通过用药控制，大部分病人都可以耐受化疗。化疗是全身性治疗，不仅作用于肿瘤细胞还作用于正常细胞，因此有一定副作用。肠癌化疗过程中也会出现化疗反应，包括比较常见的常规化疗反应，如骨髓抑制，包括白细胞、血小板减低；胃肠道反应，如恶心、呕吐、食欲减退等；还可能出现肝肾毒性、脱发等表现。 化疗反应与肠癌患者所用特定化疗药有关，如使用希罗达在治疗过程中可能出现手足综合征，表现为肢端红斑、触痛性红斑；用伊立替康患者可能会出现顽固性腹泻；铂类药物可能会引起周围神经损伤，比如周围神经、肢体末端针刺感、麻木等。