宫颈囊肿和卵巢囊肿的区别主要如下：1、位置不同：卵巢囊肿是发生在卵巢局部的病变，而宫颈囊肿是发生在宫颈局部的病变；2、临床症状不同：宫颈局部的囊肿绝大部分是指纳氏囊肿，通常在临床没有症状，并且通过妇科检查才被告知有宫颈囊肿，一般不需要进行治疗。而卵巢囊肿在相对比较小的情况下，也可能没有症状，但是随着囊肿的增大，就可能会出现下腹部疼痛，还有可能会出现急性下腹部疼痛，就是囊肿出现蒂扭转。另外，随着囊肿增大，还可能会出现局部的坠痛，还会导致月经出现紊乱等现象；3、治疗不同：宫颈囊肿没有症状的情况下，一般不用治疗，如果合并有炎症，可以给予抗炎治疗，比如口服抗宫炎片等。卵巢囊肿在没有手术指征的情况下，可以动态观察，但是随着囊肿增大，如果有手术指征，则需要进行手术治疗，手术可分为腹腔镜和开腹手术。