凝结芽孢杆菌对人体的肠道菌群紊乱所引起的急、慢性腹泻，以及消化不良等症状或者疾病能起到一定的作用，主要是因为凝结芽孢杆菌是一个既具有厌氧性质，也具有有氧性质的细菌，也就是在有氧和厌氧的条件下都能够生存。口服凝结芽孢杆菌之后，首先经过胃到十二指肠，经过胃的胃酸作用到十二指肠就变成了营养细胞，可以和人体内的有益菌共生，达到对人体有益菌起到很好的生长作用，比如有营养细胞的繁殖就会耗氧，耗氧就使得人体的双歧杆菌等厌氧菌有比较好的生存环境。另外也会生成维生素B，B族的维生素也会分泌淀粉酶、蛋白酶，也起到一定的助消化作用等。总而言之，凝结芽孢杆菌对人体肠道菌群的维持及肠道功能改善，有一定的功能和作用。