大多数的心脏手术都是在心脏停止跳动的情况下完成的。让心脏停止跳动的方法主要是灌注心肌保护液，通过心肌保护液的低温和高钾，让心脏跳动停止。心肌保护液的灌注是通过体外循环机上一个可以监测压力和量的特殊装置，然后通过升主动脉根部的一个心肌保护液灌注针灌注到心脏内。一般首次灌注心肌保护液的量为每公斤体重20-30ml，第一次灌注后25-30分钟，需重复灌注心肌保护液，目的是让心脏处于一个低温和停跳的状态，减少心脏的代谢和做功，以达到保护心肌的作用。心脏停跳的时间是由心脏外科的操作来决定的，正确地灌注心肌保护液，基本上能够得到需要的营养成分。让停跳的心脏恢复跳动，最主要的是打开升主动脉的阻断钳，让心脏的血流供应得以恢复，同时也要进行血流的复温，让心脏的温度得以恢复，从而使心脏恢复跳动。如果在升主动脉阻断钳打开以后，心脏不能自动复跳或者是出现室颤的情况，可以用电击除颤或者药物除颤的方法让它恢复跳动。对于不跳也不颤的心脏，则可以用临时起搏器带动它跳动。