牙齿根部发黄一般分外界因素和内部因素。外界因素是指牙齿的根部逐渐退缩，因为局部刺激性食物、牙结石造成牙齿根部逐渐的刺激牙龈，牙龈组织逐渐破坏、萎缩发生炎症，造成牙龈破坏，根部就附着一些色素、食物残渣，造成牙齿表面颜色发生了改变。内部因素是指牙齿本身，就是在发育的过程中，比如过去常见使用四环素牙，在牙龈牙齿发育的过程中造成牙齿本身和药物再进一步结合，造成牙齿发生改变。还有就是当地水里面含氟比较高，尤其在牙齿的发育过程中，造成牙齿表面结构发生破坏，然后结合外界因素就造成牙齿表面发红、发黑。