克林霉素和头孢菌素都属于抗菌药物，存在一些区别，具体如下：1、类别：分别属于不同类别的抗菌药物，克林霉素属于林克霉素类的抗菌药物，头孢菌素属于β-内酰胺类抗菌药物；2、抗菌机制：克林霉素主要通过抑制病原菌蛋白质合成，起到抗菌效果，头孢菌素通过抑制病原菌细胞壁的合成，发挥抗菌作用；3、抗菌谱：克林霉素主要对革兰氏阳性菌、革兰氏阴性菌以及厌氧菌具有一定抗菌作用，克林霉素对革兰氏阳性菌的抗菌活性较强，头孢菌素属于较大的抗菌药物类别。每种头孢菌素的抗菌谱存在一定区别，克林霉素在临床上可以用于治疗多种感染性疾病，可以用于呼吸系统感染，包括肺炎等，也可以用于治疗腹腔感染、盆腔感染。头孢菌素中的不同头孢临床应用基于不同抗菌谱，临床应用、适应症有所区别。青霉素过敏的患者，一般不推荐首选头孢菌素类药物，如果必须要使用时需要慎重。克林霉素和头孢菌素的区别较多，分别属于不同类别的抗菌药物，在作用机制、临床应用以及不良反应方面可能存在区别。具体选择何种药物，要遵照医嘱。