小儿隐匿性阴茎原因较多，主要是先天性因素，还有后天性因素。先天性因素主要是两个原因，第一是阴茎内膜发育异常，阴茎内膜有很好的伸缩性，小孩子阴茎内膜增厚、增粗，可导致纤维索带而失去弹性，阴茎伸缩受限制；第二是阴茎内膜附着异常，阴茎内膜附置于阴茎体前端或者阴茎颈，阴茎外观可呈锥形。后天性因素比较常见的是包皮环切术后疤痕性狭窄束缚阴茎，不能向前增长。另外一个比较常见的原因肥胖，肥胖儿童耻骨前脂肪特别多，阴茎隐匿于脂肪下，造成阴茎外观特别短小。如果小孩子隐匿性阴茎是由于先天性阴茎内膜发育异常所致，需要手术切除异常索带，让阴茎正常向前发育；如果是因为单纯性肥胖导致，以减肥为主。