新生儿肛周脓肿的治疗分两期： 1、早期：脓肿较小，或者脓肿还没有形成，仅是局部的小范围感染时，建议马上通过抗生素、抗炎的药物来进行保守处理，但是，强调的是要足疗程、规范化抗感染治疗； 2、加重期：感染持续加重，已经形成脓肿，需要联合小儿外科进行切开引流，把脓液或者是瘘管处理。引流需要在脓肿内填塞纱条，保持引流通畅，是减少肛周脓肿复发或者肛瘘形成的关键。而且术后，要加强肛周皮肤的护理，尽量减少皮肤皮损、减少脓肿再发。一旦出现这种情况，是因为皮肤的护理不到位，出院前还要进行家属的皮肤护理的宣教、教育。