脂肪填充作为目前应用比较广泛的手术，后遗症较小，比较常见的后遗症，即脂肪存活率降低。如果局部营养不良，脂肪吸收后局部会出现小结节，即营养不良后形成钙化颗粒，但通常较少发生。比较严重的后遗症即发生脂肪栓塞，若脂肪注入血管中会造成局部血管栓塞，导致皮肤坏死，甚至失明，以及脑梗等。但通常随着技术成熟，上述严重并发症或后遗症较为少见。