目前诊断肝癌的金标准仍然是病理确诊，首选应该是在B超或CT的定位下进行穿刺活检，可以获得肝癌的病理类型。在患者不能做或不愿做穿刺活检的情况下，临床诊断的标准除了临床症状和阳性体征之外，主要参考肿瘤标志物和影像学检查。影像学检查首选B超，因为B超诊断的符合率可高达84%，除了可显示肿瘤的大小形态和所在部位，以及肝静脉或门静脉有无癌栓等情况，还能发现直径2cm或者更小的病变，是目前比较有定位价值的无创检查方法，所以目前B超常常作为诊断肝癌的依据之一。慢性乙肝患者每年的体检项目中都包含腹部B超，能够及早的发现和识别早期肝硬化和肝肿瘤。此外，CT、PET-CT、肝血管造影和核磁共振等影像学检查，也是诊断肝癌的依据之一。目前CT增强和薄层扫描技术已经可以检出直径约1cm以下的早期肝癌，普美显的磁共振，可以清晰地鉴别肝硬化结节和小肝癌。但是由于CT和磁共振检查的价格，以及造影剂对身体的影响，B超常作为常规的体检项目，如果发现有异常，再进一步进行CT或者磁共振的检查。甲胎蛋白的诊断是肝癌比较灵敏的指标，如果甲胎蛋白，即AFP含量大于200μg/L，持续八周以上，或者甲胎蛋白含量大于400μg/L，持续四周，结合影像学检查，如发现肝脏有占位性病变，也可以明确诊断为肝癌。AFP同时还可以作为肝癌治疗效果的评价标准，肝癌治疗后控制理想时FP一般也相应下降。而CEA、CA19-9对于诊断肝胆管细胞癌比较敏感，两者明显升高，并且影像学上发现肝脏有占位，可以初步诊断为肝胆管细胞癌。