对于纤维肌痛的诊断，目前没有特定的化验检查，或者其他的辅助检查手段，主要是根据患者的临床特征以及典型的压痛点就可以诊断。如果患者有持续3个月以上的全身疼痛，并且在18个压痛点当中有11个是阳性的疼痛点，就可以诊断为纤维肌痛综合征。但是在诊断纤维肌痛综合征的同时，还要和其他的一些疾病来进行鉴别。主要有慢性疲劳综合症、慢性活动性的EB病毒感染，或者特发性的慢性疲劳综合症，可以有全身疼痛的情况。另外，风湿性多肌痛可以表现是肩胛带，或者颈、背、骨盆肌肉疼痛的情况，伴有发热、乏力等。但是这类的患者往往都是有血沉增快、C反应蛋白增高的情况，而且多在老年人出现。此外，就是精神风湿症，这些患者的发病带有情感色彩，疼痛定位比较模糊，而且变化也比较多，不受天气、活动的影响和患者的情绪有密切关系，而且多有情感紊乱的情况。其他的如类风湿关节炎，或者肌筋膜疼痛综合征也可以出现类似纤维肌痛的情况，所以在临床上要和这些疾病来进行鉴别。