一般难治性根尖周炎需要进行手术治疗。根尖周病变一般先通过根管治疗去除感染的牙髓组织、病变细菌，然后通过根管严密消毒，机械预备去除根管、根管壁玷污层，然后再进行严密的根管三维充填来治愈慢性根尖周炎。但是约有一小部分通过治疗以后，根尖周炎症不能去除，一般需要6-7个月复诊进行X线检查。如果根尖周病变没有减小或继续扩大，或者牙龈上窦道反复出现要进行根尖手术，通过手术方法切除根尖周病变炎性组织，通过倒充填的方法来治愈这种难治性根尖周炎。