重症肌无力的治疗包括对症治疗，即改善症状，如使用溴吡斯的明药物，该药物可以让肌无力症状显著改善，但最主要的是给患者进行对因治疗，即免疫调节治疗。免疫调节治疗分为一线、二线、三线，一线治疗通常是激素类药物和丙种球蛋白治疗，可以相对比较快速的改善肌无力症状，但丙种球蛋白是针对危象或重症患者的治疗，只需要使用5天，1个月后可以进行重复。但激素治疗是非常长期的治疗方法，一般按照1mg/kg体重强的松量给患者用到1-2个月，然后2周半片或2周1片的减量，减到半量时，即0.5mg/kg体重时还需要维持很长时间，再开始逐渐减量，部分患者改善到2-3片时便不能继续往下减，再往下减大多数患者容易复发。所以针对重症肌无力的患者，2-3片激素是终身用药，激素治疗是一种相对可控副作用偏小的方法，如果药物控制不好，还要选用他克莫司、环孢素A、硫唑嘌呤等药物，该类药物副作用大，但其改善或维持作用对于激素抵抗型患者更好。该类药物的使用到了后期因人而异，部分可能需要2-3年，部分甚至需要更长的维持时间。