房颤射频术后的后遗症主要有以下几种：1、穿刺伤口有可能出血而形成血肿，血肿消散可能需要一段时间；2、射频消融术目前可治疗阵发性心房颤动、持续性心房颤动小于2年的患者，但治疗的策略和方法的成功都不是100%，有一定复发和不成功的情况；3、射频消融术可能会对左房后壁毗邻的器官即食道产生影响，可能会造成食道黏膜的损伤，需要在术后1个月流食，而且还要口服胃肠道黏膜的保护剂；4、左房的食道瘘是最严重的一种并发症，也是在手术过程中非常需要注意的情况；5、房颤射频消融时要打断心房颤动肺静脉起源的异位电位，需要将总的控制权交回到窦房结。但是部分患者可能由于心房颤动长期发生，抑制窦房结的功能，或者窦房结功能本来存在障碍，所以非常少患者在房颤射频术后，可能需要安装心脏起搏器。虽然房颤射频术后存在后遗症或者并发症，但是不要因为可能会出现这些并发症而害怕做手术，因为手术对于心房颤动患者还是获益较大。