脚的小拇趾疼痛的原因如下：1、脚趾劳损：由于走路过多或负重，引起水肿；2、局部的关节滑膜病变：考虑是否有痛风等全身性疾病，引起局部的关节滑膜病变发作；3、小趾病变：排除小趾是否有囊肿、肌腱以及骨关节的病变，小拇趾在脚的行走和负重，起着比较重要的作用。由于频繁行走，脚活动过多，或长时间负重引起的局部疼痛，类似于滑膜水肿或滑膜炎症，出现疼痛症状；4、痛风：特殊疾病引起的小脚趾关节疼痛，由痛风疾病引起，可能食用嘌呤含量较高的食物而诱发，比如动物内脏、海鲜、啤酒等，出现局部的红肿热痛；5、关节退行性病变：年龄增大引起关节退变、滑膜炎症；6、类风湿疾病：除痛风外，类风湿疾病也会引起局部脚趾疼痛；7、关节病变或组织生长异常：比如生长囊肿，肌腱中囊肿出现腱鞘囊肿或腱鞘炎卡压。骨关节的病变，有骨疣或甲下的肿瘤的长，也可能导致小脚拇趾疼痛的发生。