藿香正气水治疗灰指甲没有任何的道理，因为灰指甲如果是真菌感染，真菌是一个微生物，，长到指甲上指甲是它的营养剂，在吃指甲的同时会把指甲破坏了，所以要把真菌给杀死才能治疗灰指甲。藿香正气水里面不含有抗细菌，抗病毒，抗真菌的成分，有时候可能是巧合，可能本身就不是真正的甲真菌感染，指甲可能血液循环不好，指甲周围的皮肤没有保护好，如果注意到这一点，周围的皮肤好了以后，长出新的指甲，坏的指甲就没有了。所以藿香正气水治疗灰指甲理论上不科学，如果不能够杀死真菌，就没有治疗灰指甲的作用。