男性小便呈腥臭味，主要原因具体如下：1、化脓性肾盂肾炎：常见于化脓性肾盂肾炎的患者，出现尿频、尿急、尿痛症状，还会出现发热、腰酸、腰痛症状，尿液中呈腥臭气味；2、慢性前列腺炎：慢性前列腺炎患者发生尿潴留时会出现大量残余尿，残余尿中致病微生物刺激尿素分解产生氨气，出现尿液呈骚臭气味的表现；3、膀胱结肠瘘：发生膀胱结肠瘘时会出现尿液呈臭味的表现，部分患者在大量饮水后会出现尿液呈腥臭气味的情况；4、泌尿系化脓性感染：发生化脓性膀胱炎时会出现尿液呈腥臭气味，建议及时到泌尿外科就诊，通过中段尿培养找到致病微生物，选择有效的抗生素，配合中成药物治疗，多数患者尿液呈腥臭气味的症状会明显好转。