皮脂腺囊肿主要是因为外部脏物，或人体自身产出的油脂堵塞皮脂腺孔，导致下次分泌时分泌物无法流出而形成。预防方法为保持皮肤清洁，尤其是油性皮肤患者需更加注意，以保证皮脂腺每次分泌的异物均可顺畅流出，可减少皮脂腺囊肿发生。但通常将身体每个部位清洁到位较为困难，所以有时皮脂腺囊肿难以避免。因皮脂腺囊肿主要发生于后背、头皮及腹部，若未出现在面部，无需过于在意。