精子头部缺陷，首先从常规形态学角度来说，精子头部缺陷包含大头、小头、锥形头、梨形头、圆头、不定形头、有空泡的头，顶体后区有空泡。以及顶体区域过小或过大，顶体区过小指顶体区小于整个精子头部面积的40%。顶体区过大指顶体区域大于精子头部整体面积的70%。双头、多头以及缺陷的顶体组合，因为精子头部包含顶体酶和遗传物质，所以如果精子头部缺陷率过高，就会导致精子和卵子发生顶体反应时。由于酶缺陷或酶不够，所以导致无法发生顶体反应，而出现精子和卵子不结合，也就是经常说的不受精，或由于顶体后区DNA物质受到影响，即使发生了顶体反应受精，受精后也无法形成胚子，或胚子形成之后，可能会导致胚胎不发育、胚胎发育停滞或流产。一般情况下，一个精子和一个卵子结合，常规一份精液标本里面存在正常的精子比例非常多，所以畸形精子、头部有缺陷的精子和正常精子相比，正常精子更容易和卵子结合。