通过灌肠对孩子的某些疾病可能会有些帮助，但是孩子频繁使用灌肠，可能会造成以下副作用和影响：1、肛门括约肌的损伤：因为灌肠的过程中，如果操作手法不熟练，特别是小孩子不配合的情况下，容易对肛门有些损伤，特别是频繁使用的时候，对肛门括约肌，也会造成一些影响；2、肠道菌群失调：在使用灌肠治疗的过程中，有可能会影响到孩子正常肠道菌群的状态，可能会出现肠道菌群失调，对孩子肠道的状态，会造成不良的影响。有一些孩子，经常使用灌肠，有些药物对肠道也会有刺激性，对于肠道的正常蠕动，也会造成不良影响。所以在使用灌肠时，一定是在口服用药不能缓解或不能适应的情况下，再选择用灌肠治疗，多数的情况下，建议尽量口服用药。相对来说口服用药吸收利用度，比较有效和准确，通过肛门灌肠以后，有些可能在打进去一部分药以后，有一部分会随着肛门排出，所以药物的有效性，并不是非常合理或者有效。